claro, porque tirará de algún acceso directo o alguna ruta.
deberías de mirar a qué archivos sistema hace referencia, y modificar las rutas o crear accesos directos y que los llame
por eso es importante hacer un buen particionado, y por eso Windows es una puta mierda, pásate a Linux hombre, te hubieses creado tu partición para /opt y no hubieses tenido esos problemas ;)